转录组是指某个物种特定细胞或组织在某一状态下所转录出来产生的所有转录本的集合。对真核有参生物进行转录组测序，既可定量测定每个转录本在生长过程中和不同的条件下的表达水平的变化，还可以对基因结构进行分析，研究SNP、可变剪切、基因结构优化等信息。通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或者器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。